재판 시작이후 3년2개월 지난  2심 재판의 주심인 김선혜판사는 거의 20여페이지에 걸친 판결문의 요점을 10여분간 요약하여 발표한 다음 선고를 하고 곧장 구속영장을 발부하고 입감을 명령했다.

원래 공소장에 기재된 18건의 간통사실 중 1심에서는 4건을 유죄로 하고 1건을 무죄로 하였었는 데 2심 재판부는 1심을 파기하고 5건 모두 유죄로 인정했다.

또한 간통이 이뤼진 것으로 알려진 날짜와 시간을 전후해서 서기종과 윤00 피고의 전화 빈도수가 빈번한 것이 통상 담임목사와 전도사간의 업무때문이라고 볼 수 없다고 하였다.

또한 서기종피고측에서 이메일이 조작되었다고 하였으나 이미 서기종이 고소인 윤00 남편에게 써준 자필 각서에 "윤00과 주고받은 모든 이메일을 인정한다'는 내용이 들어 있고 서기종피고인은 윤00와 전도사에 관한 업무 접촉밖에 없다고 하면서도 굳이 그런 자필 각서를 써준 점, 컴퓨터에 한메일 접속 기록이 없다는 점을 주장하였으나 아웃룩 기록은 삭제하지 않는 한 남아있는 데 모든 기록이 없는 점을 미루어 고의로 삭제한 것이라고 판시하였다.

더구나 서기종피고인은 개전의 모습이 전혀 없으므로 1심 선고를 그대로 선고한다고 했으며, 윤00 피고는 자백을 하였고 선처를 구하였으나 형량의 형평성을 들어 역시 1심 형량을 선고한다고 하였다.

이로써 동대문교회 서기종목사의 간통사건은 일단락되었다. 대법원 상고절차가 있다고 하지만 간통같은 것에 관련된 파렴치범에 대해서는 대법원에 상고할런지도 의문이지만  이 3년 2개월동안에 긴 심리로 말미암아 대법원 판결이 바뀔 가능성은 거의 없다.

감리교회는 지지난번 25회 입법총회 때에 일반 사회법에서 실형을 받은 목회자는 행정책임자가 반드시 감리교회 재판에 회부하여 중벌을 내리도록 엄하게 개정한 바 있으니 해당 서울연회 감독과 감리교 본부 신경하감독회장이 서기종목사를 어떻게 신속히 치리할른지 귀추가 주목된다.

그동안 서기종목사는 무슨 배짱에서인지 서울연회는 물론 종로지방회에 한번도 참석안하고 버텨왔음에도 아무런 제제는 커녕 경고한 번 발하지 못한 서울연회나 종로지방회의 구성원들이 이 사건을 어떻게 처리할른지도 초미의 관심사다. 계속해서  아무일도 없었다는 듯이 나몰라라할 수는 없을 것 이다.  신속하고 강력한 치리가 요구된다.